More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3132 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  59.8 
 
 		 202 aa  250  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  45.79 
 
 		 211 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  46.32 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  42.5 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  43.16 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  43.16 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  44.27 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  41.38 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  37.63 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  41.87 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  39.89 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  42.08 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  48.1 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  39.47 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  40.11 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  37.36 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  38 
 
 		 187 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  38.41 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  36.84 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  38.41 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  40.37 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  40.37 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  39.25 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  36.32 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  38.61 
 
 		 389 aa  121  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  34.21 
 
 		 182 aa  121  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  37.13 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  37.13 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  37.16 
 
 		 180 aa  119  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  34.95 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  37.21 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.88 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  32.8 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  35.85 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  30.53 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  27.87 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  28.4 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  32.39 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  27.47 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  26.9 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  28.65 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  32.81 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  38.04 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  38.04 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  33.05 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  27.66 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  35.79 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  33.05 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  33.05 
 
 		 345 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.36 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.36 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.36 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  31.36 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  35.05 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1910  phosphosugar-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  35.71 
 
 		 340 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  32.14 
 
 		 341 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  33.61 
 
 		 320 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  33.61 
 
 		 320 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2083  RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  34.78 
 
 		 311 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  34.69 
 
 		 341 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3018  RpiR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 256 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  29.08 
 
 		 323 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  31.78 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1282  sugar isomerase (SIS)  27.4 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.418782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  30.83 
 
 		 323 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  29.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  29.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  24.04 
 
 		 292 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  33.68 
 
 		 323 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 328 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  29.23 
 
 		 334 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  28.12 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  27.69 
 
 		 329 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  33.96 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  29.2 
 
 		 282 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 338 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  27.59 
 
 		 324 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 282 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 340 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  32.87 
 
 		 331 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02030  transcriptional regulatory protein HexR  27.34 
 
 		 288 aa  52  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  33.02 
 
 		 340 aa  51.6  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  31.63 
 
 		 333 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  27.05 
 
 		 325 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>