89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2930 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  43.71 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  38.38 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.42 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  39.63 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  39.77 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  37.8 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  40 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.17 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  38.07 
 
 		 389 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  33.88 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  35.47 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  39.76 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  39.76 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  35.32 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  35.64 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.71 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  36.96 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  36 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  31.91 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  31.95 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  33.14 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  33.14 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  32.57 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  31.38 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  31.38 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  35.54 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  37.84 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  33.71 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  34.69 
 
 		 194 aa  90.9  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  35.4 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  32.93 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  36.14 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  35.54 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  33.73 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  36.54 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  34.5 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  39.29 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  30.56 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  34.38 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  33 
 
 		 324 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  32.41 
 
 		 353 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 285 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  32.17 
 
 		 285 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  32.17 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.17 
 
 		 285 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  32.17 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 282 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  32.17 
 
 		 285 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  32.81 
 
 		 278 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  29.66 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2031  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.73 
 
 		 284 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0294963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  26.36 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.32 
 
 		 308 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  33.67 
 
 		 299 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 304 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  28.72 
 
 		 321 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.66 
 
 		 284 aa  44.7  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  31.31 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0718  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.12 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  28.35 
 
 		 272 aa  43.9  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  30.37 
 
 		 326 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 315 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  26.74 
 
 		 320 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  32.41 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003760  glucose repressor HexR for Entner-Doudoroff pathway RpiR family  23.66 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  29.57 
 
 		 333 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1831  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.79 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  26.79 
 
 		 329 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  27.12 
 
 		 323 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2360  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.93 
 
 		 286 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.19 
 
 		 363 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  32.04 
 
 		 244 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4364  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.01 
 
 		 289 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.14 
 
 		 284 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 324 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  32.32 
 
 		 397 aa  41.2  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  29.91 
 
 		 282 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  29.66 
 
 		 324 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  30.53 
 
 		 338 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  29.91 
 
 		 323 aa  41.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 279 aa  40.8  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 279 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  27.33 
 
 		 329 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>