More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0910 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  70 
 
 		 191 aa  280  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  66.84 
 
 		 199 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  64.21 
 
 		 211 aa  261  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  58.95 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  53.09 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  46.91 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  44.74 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  47.42 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  43.16 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  47.03 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  47.59 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  44.39 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  44.79 
 
 		 202 aa  147  9e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  45.45 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  46.82 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  45.28 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  39.15 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  37.57 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  39.15 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  37.57 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.38 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  35.45 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  39.88 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  40.37 
 
 		 389 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  41.82 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  41.82 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.89 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  35.63 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  37.16 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  34.22 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.52 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  34.46 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  32.97 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  37.89 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  35.4 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  32.04 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  31.43 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  30.32 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  28.28 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  29.1 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  36.54 
 
 		 397 aa  64.7  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  34.86 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  28.8 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  32.77 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0042  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  33.64 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  29.19 
 
 		 340 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 278 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  29.91 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2742  DNA-binding transcriptional regulator HexR  34.31 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  26.36 
 
 		 344 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1082  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.15 
 
 		 288 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474941  unclonable  0.00000000000467577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 273 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  29.03 
 
 		 281 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  33.02 
 
 		 284 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  25.93 
 
 		 329 aa  51.6  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.83 
 
 		 299 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  25.67 
 
 		 324 aa  51.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  32.48 
 
 		 330 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  29.75 
 
 		 334 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 304 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.14 
 
 		 282 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  30.48 
 
 		 321 aa  51.2  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 337 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0668  RpiR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  31.62 
 
 		 292 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  30.28 
 
 		 340 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  30.83 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  29.91 
 
 		 326 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  26.16 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  24.82 
 
 		 327 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  28 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3144  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.57 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0232322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  26.13 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2083  RpiR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  28.97 
 
 		 288 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  24.86 
 
 		 315 aa  49.3  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  27.71 
 
 		 324 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 642 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  29.91 
 
 		 353 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  25.53 
 
 		 321 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 642 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 642 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.18 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 282 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 338 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 282 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 272 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  31.18 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 641 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 620 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 282 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>