69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3252 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  82.8 
 
 		 186 aa  321  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  46.52 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  45.99 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  41.24 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  41.24 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  36.32 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  41.4 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  39.77 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  39.55 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  39.55 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  34.97 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  35.5 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  34.22 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  33.7 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  33.67 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  31.96 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  33.68 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  35.76 
 
 		 389 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.59 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  36.41 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  35.33 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  35.33 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  35.63 
 
 		 200 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  35.03 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.08 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  33.76 
 
 		 194 aa  94.7  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  33.33 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  33.33 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  32.82 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.16 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  34.18 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  33.52 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.73 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  27.84 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  26.97 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  29.94 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  27.6 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  30.27 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  32.52 
 
 		 281 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 273 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  26.45 
 
 		 397 aa  48.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4018  RpiR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 284 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 266 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  28.85 
 
 		 266 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 279 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 279 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3998  transcriptional regulator, RpiR family  28.33 
 
 		 312 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30 
 
 		 609 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 282 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  25.19 
 
 		 272 aa  42  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 		 339 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  28.36 
 
 		 339 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 278 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2360  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.67 
 
 		 286 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190607 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0178  RpiR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 291 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0183  helix-turn-helix protein RpiR  26.75 
 
 		 291 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  28.36 
 
 		 339 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2031  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.97 
 
 		 284 aa  41.2  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0294963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  26.29 
 
 		 280 aa  41.2  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  28.77 
 
 		 340 aa  41.2  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>