More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1479 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  59.01 
 
 
599 aa  687    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  100 
 
 
589 aa  1208    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  80.62 
 
 
583 aa  954    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  58.75 
 
 
593 aa  710    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  57.95 
 
 
593 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  51.96 
 
 
588 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  50.86 
 
 
599 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  48.21 
 
 
587 aa  530  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  49.29 
 
 
578 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  47.43 
 
 
1106 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  44.86 
 
 
579 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  46.48 
 
 
580 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.44 
 
 
578 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
578 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  46.3 
 
 
580 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  44.44 
 
 
578 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
578 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
578 aa  502  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
578 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  43.84 
 
 
582 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
578 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  44.44 
 
 
578 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
578 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  45.61 
 
 
575 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 
578 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  46.64 
 
 
581 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
578 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 
578 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 
578 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 
579 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  44.46 
 
 
583 aa  495  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  43.66 
 
 
576 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  44.1 
 
 
578 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  46.18 
 
 
576 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  44.86 
 
 
578 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  46.48 
 
 
592 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 
592 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  42.52 
 
 
594 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  46.4 
 
 
585 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
580 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  43.03 
 
 
580 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  44.48 
 
 
590 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  42.81 
 
 
590 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  43 
 
 
585 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  44.46 
 
 
580 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  43.8 
 
 
580 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  43.63 
 
 
582 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  43.81 
 
 
617 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.37 
 
 
510 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
551 aa  409  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.39 
 
 
651 aa  405  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  39.28 
 
 
541 aa  387  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.85 
 
 
667 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  38.97 
 
 
921 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  37.54 
 
 
906 aa  360  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  37.25 
 
 
933 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  55.83 
 
 
1171 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.14 
 
 
914 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  54.13 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  32.68 
 
 
912 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  48.76 
 
 
512 aa  251  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50 
 
 
319 aa  248  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  48.55 
 
 
248 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  48.32 
 
 
257 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  47.92 
 
 
325 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  51.83 
 
 
320 aa  243  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  48.09 
 
 
270 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  51.12 
 
 
319 aa  241  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  49.78 
 
 
314 aa  239  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  51.08 
 
 
333 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  48.09 
 
 
247 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  51.12 
 
 
319 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  51.6 
 
 
308 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  46.84 
 
 
255 aa  236  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  49.54 
 
 
324 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  53.27 
 
 
322 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
350 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15212  predicted protein  32.31 
 
 
475 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  48.44 
 
 
308 aa  231  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  50 
 
 
314 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  53.08 
 
 
322 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
309 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  44.62 
 
 
323 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  40.97 
 
 
924 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  46.12 
 
 
322 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  52.61 
 
 
322 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  47.35 
 
 
316 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  44.4 
 
 
932 aa  227  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  38.73 
 
 
307 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  46.38 
 
 
275 aa  225  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  47.11 
 
 
308 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  48.04 
 
 
312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  50 
 
 
305 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 
308 aa  223  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  40.78 
 
 
916 aa  223  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  48.89 
 
 
307 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  42.91 
 
 
906 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 
315 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  39.36 
 
 
906 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>