More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0658 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 447 aa  879    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  78.38 
 
 		 452 aa  705    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0369  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2375  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.529747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.84 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 426 aa  152  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  29 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0468  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3406  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  27.79 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0382  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0449  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 420 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  26.76 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  26.76 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  28.21 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.76 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.76 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0234  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.76 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.76 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  27.98 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  26.76 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  27.98 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1215  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3251  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  27.54 
 
 		 434 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  28.21 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 422 aa  136  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  28.43 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  29.16 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  28.07 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  28.07 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 406 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  26.94 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  27.51 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  27.76 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  26.37 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 462 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3956  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00119872  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  28.98 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  28.79 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  27.08 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  25.64 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  28.24 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.98 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.98 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.98 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  28.5 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  28 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  28.06 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  28 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  28 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  25.26 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 527 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 453 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 454 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2986  general substrate transporter  29.62 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.27 
 
 		 445 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  26.22 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0408  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.03 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6280  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190534  normal  0.556482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>