More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0518 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0518  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
567 aa  1103    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  79.82 
 
 
562 aa  851    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  55.98 
 
 
562 aa  597  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  50.88 
 
 
589 aa  596  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  51.24 
 
 
596 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  46.09 
 
 
592 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 
582 aa  545  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 
573 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  47.34 
 
 
582 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 
581 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  48.58 
 
 
610 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  46.21 
 
 
560 aa  498  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 
608 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  46.22 
 
 
576 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  45.42 
 
 
570 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 
591 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  43.93 
 
 
641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 
578 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  44.28 
 
 
587 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  44.28 
 
 
587 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  44.28 
 
 
587 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  41.49 
 
 
589 aa  382  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.6 
 
 
486 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  35.48 
 
 
477 aa  248  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.09 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  33.8 
 
 
486 aa  204  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.45 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  28.34 
 
 
470 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 
477 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 
465 aa  176  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.35 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 
489 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 
478 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  30.63 
 
 
477 aa  171  5e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 
493 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.32 
 
 
500 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 
483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  30 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.88 
 
 
465 aa  163  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.88 
 
 
465 aa  163  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 
475 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 
474 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 
522 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 
475 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 
477 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 
504 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  31.46 
 
 
467 aa  160  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 
477 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
528 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 
461 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.84 
 
 
462 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  30.68 
 
 
476 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  30.8 
 
 
582 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 
478 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.62 
 
 
519 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  30.8 
 
 
582 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  31.28 
 
 
582 aa  150  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  31.03 
 
 
582 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  29.86 
 
 
453 aa  150  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  28.64 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.08 
 
 
524 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  30.04 
 
 
487 aa  147  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.31 
 
 
482 aa  147  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.27 
 
 
480 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 
585 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.23 
 
 
505 aa  146  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.73 
 
 
495 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
460 aa  146  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.26 
 
 
532 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.49 
 
 
489 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 
478 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 
520 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  30.3 
 
 
457 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 
482 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 
482 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.05 
 
 
469 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.93 
 
 
539 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  26.61 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.35 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  29.59 
 
 
467 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  27.02 
 
 
507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.24 
 
 
520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.74 
 
 
512 aa  141  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  30.28 
 
 
465 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 
474 aa  140  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  25.22 
 
 
537 aa  140  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  26.85 
 
 
501 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 
478 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
457 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 
518 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
491 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 
579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.01 
 
 
509 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 
529 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  27.63 
 
 
515 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  27.43 
 
 
508 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>