More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5625 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 482 aa  921    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.86 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 		 475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  33.8 
 
 		 508 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.54 
 
 		 495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 487 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.98 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.99 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 560 aa  189  9e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  32.43 
 
 		 576 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 501 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 581 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.51 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.99 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 		 522 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.57 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.11 
 
 		 500 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  32.49 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.55 
 
 		 489 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  31.01 
 
 		 492 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.51 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  32.27 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.55 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 582 aa  170  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  31.63 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 570 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 609 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  29.83 
 
 		 592 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 608 aa  167  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 587 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  31.4 
 
 		 587 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  32.65 
 
 		 537 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 505 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.34 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 646 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 646 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.43 
 
 		 627 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 646 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 478 aa  162  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.9 
 
 		 525 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 476 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 493 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 570 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 503 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 466 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.24 
 
 		 504 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 		 502 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 641 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 589 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  29.56 
 
 		 579 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 562 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  33.57 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.92 
 
 		 539 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  28.1 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>