More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4711 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  100 
 
 		 292 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  43.6 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  39.45 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  37.85 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0430  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151823  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  39.45 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  40.34 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  37.89 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  30.67 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.24 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  30 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  30.34 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4592  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  30 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.69 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  28.91 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.43 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.72 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  26.94 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.82 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0332  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  29 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  30 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  27.4 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  32.28 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  26.8 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  30.94 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  26.99 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2270  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0241191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  29.76 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0468  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  0.15939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>