More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1437 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  100 
 
 		 297 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  79.93 
 
 		 296 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  72.7 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  74.15 
 
 		 299 aa  404  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  70.65 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  72.01 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  71.67 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  72.01 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  63.82 
 
 		 293 aa  362  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  65.53 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  65.53 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  65.53 
 
 		 293 aa  361  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  64.85 
 
 		 293 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  65.87 
 
 		 293 aa  345  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  64.51 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  60.41 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  58.55 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  57.24 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  58.61 
 
 		 304 aa  308  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  58.22 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  55.66 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  53.4 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  52.56 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  50.46 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1157  inner-membrane translocator  53.53 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0459  inner-membrane translocator  53.05 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.575619  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0468  inner-membrane translocator  53.05 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  0.15939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  48.48 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  52.9 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  52.1 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  51.06 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  49.84 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  48.78 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2277  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  50.76 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0952  inner-membrane translocator  50.76 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.778848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0602  inner-membrane translocator  53.72 
 
 		 309 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.650417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3436  inner-membrane translocator  53.72 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00170509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3540  inner-membrane translocator  51.29 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740436  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5037  inner-membrane translocator  52.77 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  45.02 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.05 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  31.77 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.66 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4063  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1683  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00416283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2359  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2378  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  27.71 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  28.2 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 603 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  28.2 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 603 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 603 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.79 
 
 		 603 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 603 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>