More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0251 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  100 
 
 
304 aa  591  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  81.25 
 
 
304 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  80.26 
 
 
304 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  78.62 
 
 
304 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  63.49 
 
 
293 aa  359  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  61.18 
 
 
293 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  62.17 
 
 
293 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  62.5 
 
 
293 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  61.84 
 
 
293 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  61.84 
 
 
293 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  59.87 
 
 
293 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  57.57 
 
 
293 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  60.2 
 
 
293 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  60.2 
 
 
293 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  60.86 
 
 
293 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  58.42 
 
 
296 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  58.55 
 
 
297 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  60.53 
 
 
293 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  56.78 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  57.55 
 
 
309 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  60.53 
 
 
293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  52.28 
 
 
328 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  60.07 
 
 
299 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  53.37 
 
 
326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  53.8 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  57.86 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0468  inner-membrane translocator  57.55 
 
 
309 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  0.15939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0459  inner-membrane translocator  57.55 
 
 
309 aa  299  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.575619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  56.33 
 
 
309 aa  298  9e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1157  inner-membrane translocator  55.97 
 
 
309 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  56.96 
 
 
310 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  52.89 
 
 
329 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  51.98 
 
 
328 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3436  inner-membrane translocator  58.54 
 
 
309 aa  285  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00170509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2277  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  51.68 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0952  inner-membrane translocator  51.68 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.778848 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5037  inner-membrane translocator  55.73 
 
 
315 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0602  inner-membrane translocator  58.49 
 
 
309 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.650417  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3540  inner-membrane translocator  55.7 
 
 
309 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  35.92 
 
 
297 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
295 aa  175  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
297 aa  175  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  35.14 
 
 
297 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
297 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
291 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
290 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  41.78 
 
 
292 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
297 aa  165  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  34.43 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  34.92 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  37.84 
 
 
297 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 
294 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.43 
 
 
294 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
294 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  36.6 
 
 
297 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  39.41 
 
 
295 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  37.79 
 
 
297 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.55 
 
 
297 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  32.69 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  32.69 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  37.38 
 
 
302 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  39.22 
 
 
293 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
296 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  38.89 
 
 
293 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  36.07 
 
 
291 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  32.04 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  37.83 
 
 
296 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  34 
 
 
294 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  29.84 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  30.31 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  29.52 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  37.62 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  30.94 
 
 
309 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  30.94 
 
 
309 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  30.16 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.82 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  32.03 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  30.19 
 
 
316 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.82 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.82 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.15 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.82 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  29.21 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  30.31 
 
 
309 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  30.5 
 
 
317 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  30.48 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  29.97 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  31.15 
 
 
294 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  29.52 
 
 
338 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
289 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  30.16 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.87 
 
 
316 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>