More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0544 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  554  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  92.83 
 
 		 293 aa  457  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  86.01 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  48.31 
 
 		 295 aa  270  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  59.25 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  48.47 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  44.75 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  45.08 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.42 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  46.76 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  43.64 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  43.05 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 		 294 aa  221  9e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  43.34 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  46.29 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  42.52 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  41.3 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  40 
 
 		 291 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.92 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2378  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  41.55 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  40.34 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2359  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4063  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.09 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  39.6 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  40.6 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  39.6 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  41.36 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  40 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0031  inner-membrane translocator  44.24 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.86 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  36.11 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  38.24 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.53 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.2 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1157  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.43 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.16 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3540  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0468  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  0.15939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>