More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2359 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2359  inner-membrane translocator  100 
 
 		 292 aa  551  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  75.68 
 
 		 294 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  75.95 
 
 		 296 aa  415  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4063  inner-membrane translocator  74.32 
 
 		 292 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0031  inner-membrane translocator  73.63 
 
 		 293 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  43.34 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  45.21 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  43.6 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.8 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  43.3 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  37.09 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  38.72 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2378  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  35.86 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.01 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.13 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  35.23 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.74 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  32.65 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  32.22 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  34.37 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.65 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.65 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  32.69 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>