More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5037 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5037  inner-membrane translocator  100 
 
 		 315 aa  597  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  62.06 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  63.78 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  64.82 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  64.4 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1157  inner-membrane translocator  64.08 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0468  inner-membrane translocator  63.02 
 
 		 309 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  0.15939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0459  inner-membrane translocator  63.02 
 
 		 309 aa  359  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.575619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3436  inner-membrane translocator  63.75 
 
 		 309 aa  352  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00170509 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  62.46 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3540  inner-membrane translocator  61.09 
 
 		 309 aa  345  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0602  inner-membrane translocator  62.7 
 
 		 309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.650417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  57.57 
 
 		 293 aa  322  7e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  58.55 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.58 
 
 		 293 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  53.7 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  55.73 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  58.55 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  56.91 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  54.24 
 
 		 329 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  58.22 
 
 		 293 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  55.59 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  51.96 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  51.21 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  54.93 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  54.93 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  57.19 
 
 		 304 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 293 aa  295  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  56.59 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2277  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  52.42 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0952  inner-membrane translocator  52.42 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.778848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  55.52 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  55.19 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  51.63 
 
 		 293 aa  285  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  55.26 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  50.91 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.1 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  52.44 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  50.95 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  42.43 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.35 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  33.44 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.95 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  27.97 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  29.62 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  27.56 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.24 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  27.24 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.53 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.24 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.92 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2359  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>