More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0137 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  100 
 
 
302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  80.13 
 
 
297 aa  404  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  45.12 
 
 
297 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  45.03 
 
 
295 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.97 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  43.81 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  43.14 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  44.78 
 
 
297 aa  228  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  41.81 
 
 
297 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  49.83 
 
 
292 aa  222  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  43.29 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  47.42 
 
 
293 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  48.04 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
301 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  39.73 
 
 
297 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  40.27 
 
 
297 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
297 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  39.6 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  42.28 
 
 
297 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  47.02 
 
 
293 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  36.63 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
290 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3609  inner-membrane translocator  38.8 
 
 
309 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.566086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  40.74 
 
 
294 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3363  inner-membrane translocator  38.8 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
291 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5008  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
309 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  39.54 
 
 
296 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
291 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0785  inner-membrane translocator  38.85 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2444  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
304 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  37.09 
 
 
293 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 
293 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2378  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
304 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0568  putative branched-chain amino acid transport system permease  37.46 
 
 
310 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451582  normal  0.0433103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0468  inner-membrane translocator  39.75 
 
 
309 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  0.15939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0459  inner-membrane translocator  39.75 
 
 
309 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.575619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  37.06 
 
 
304 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
293 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 
296 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0216  inner-membrane translocator  39.16 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  38.36 
 
 
296 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  38.74 
 
 
293 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2723  inner-membrane translocator  38 
 
 
304 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956007  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  38.41 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  34.54 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  37.09 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  34.53 
 
 
293 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
294 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.49 
 
 
300 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
290 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4063  inner-membrane translocator  38.8 
 
 
292 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1157  inner-membrane translocator  37.26 
 
 
309 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0262  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
304 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.79 
 
 
293 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3540  inner-membrane translocator  37.22 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  37.09 
 
 
293 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3436  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00170509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  39.6 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0602  inner-membrane translocator  38.17 
 
 
309 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.650417  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
290 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  34.45 
 
 
293 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
293 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  34.45 
 
 
293 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0031  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
293 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
302 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0115  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
328 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342029  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  36.24 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.27 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2219  inner-membrane translocator  34.32 
 
 
329 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.515204  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  30.98 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0376  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  35.06 
 
 
329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262788  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  32.68 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
302 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.05 
 
 
301 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  30.33 
 
 
291 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
295 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5037  inner-membrane translocator  37.94 
 
 
315 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  32.78 
 
 
290 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  31.53 
 
 
308 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  32.03 
 
 
319 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2359  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
292 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
295 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4006  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
328 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0050  inner-membrane translocator  35.06 
 
 
326 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.681115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3164  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109839  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 
299 aa  136  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5288  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.653195  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
294 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  31.53 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>