More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1694 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  100 
 
 		 443 aa  850    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  46.62 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  54.31 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  43 
 
 		 413 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  43.2 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  46.09 
 
 		 412 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  46.24 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  45.09 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  36.89 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  37.8 
 
 		 486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  40.27 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  35.81 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  34.3 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  32.97 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  37.97 
 
 		 406 aa  167  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  37.31 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  34.92 
 
 		 400 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  36.54 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  36.31 
 
 		 397 aa  146  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  31.11 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  33.68 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  31.71 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  30.69 
 
 		 348 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  37.46 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  28.76 
 
 		 345 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.1 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.39 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 368 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.94 
 
 		 343 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 340 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.62 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  29.75 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  28.97 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.71 
 
 		 348 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  27.3 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.68 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.31 
 
 		 345 aa  97.8  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.72 
 
 		 370 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  25.32 
 
 		 348 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.22 
 
 		 341 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.74 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  30.25 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  28.1 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 		 368 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.28 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.28 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.52 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.27 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  27.33 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  27.33 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  27.33 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  27.33 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  27.33 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  31.95 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.02 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  28.53 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  29.84 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  27.15 
 
 		 345 aa  92.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.61 
 
 		 361 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.61 
 
 		 361 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  24.51 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  28.29 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.18 
 
 		 363 aa  90.5  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.31 
 
 		 378 aa  90.5  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.3 
 
 		 371 aa  90.1  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  27.06 
 
 		 435 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.97 
 
 		 373 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  27.55 
 
 		 359 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.46 
 
 		 379 aa  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  27.74 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  33.69 
 
 		 407 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  30.1 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.97 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.69 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  30.1 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  30.1 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  30.1 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  30.1 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.9 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.9 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  29.45 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.9 
 
 		 348 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  29.45 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  29.45 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  29.45 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.9 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  26.13 
 
 		 526 aa  88.6  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.97 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  29.45 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>