More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1271 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 383 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  65.17 
 
 		 380 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  59.22 
 
 		 528 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  54.86 
 
 		 357 aa  342  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  54.7 
 
 		 371 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  52.54 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  49.58 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 365 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 371 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  34.6 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 354 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 354 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.96 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  34 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 410 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  32.04 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.14 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 451 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 352 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.99 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.89 
 
 		 471 aa  133  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 417 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  33.71 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  33.71 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 463 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.73 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.74 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  31.04 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  30.33 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  34.46 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  30.96 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>