105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0357 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  68.29 
 
 		 135 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  68.29 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  62.4 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  61.6 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  62.9 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  59.02 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  58.68 
 
 		 140 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  54.47 
 
 		 143 aa  149  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  57.6 
 
 		 151 aa  146  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  57.26 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  56.45 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  57.38 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  54.84 
 
 		 146 aa  139  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  52.03 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  54.92 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  53.28 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  54.47 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  52.46 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  54.26 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  52.34 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  48.8 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  54.26 
 
 		 139 aa  126  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  53.39 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  45.67 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  49.58 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  50.85 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  46.03 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  60 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  45.6 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  49.19 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  49.19 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  46.77 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  51.64 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  47.15 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  50.46 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  48.62 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  45.24 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  48.25 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  45.53 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  47.54 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  47.06 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  46.9 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  45.9 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  45.08 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  44.53 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  48.62 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  46.22 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  42.86 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  44.72 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  45.08 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  47.62 
 
 		 136 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  43.44 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  47.54 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  41.8 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  45.67 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  45.38 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  49.59 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  46.9 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  46.9 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  46.9 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  44.8 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  47.79 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  42.28 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  38.66 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  38.84 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  38.02 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  39.67 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  39.84 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  35.77 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  36.07 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  40.16 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  36.72 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  35.25 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  34.13 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  35.2 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.59 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  35.25 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  38.71 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  36 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  32.79 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  35.9 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  26.47 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  28.97 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  29.91 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  29.91 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  31.19 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  29.66 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>