More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0249 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  100 
 
 		 359 aa  714    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  48.26 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  41.5 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  40.79 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  41.58 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  47.92 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  40.57 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  41.6 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  36.96 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  43.23 
 
 		 375 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  33.24 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  34.59 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  33.9 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  41.22 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  35.63 
 
 		 455 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  37.06 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  33.24 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  37.46 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  35.61 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 488 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 		 781 aa  92  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  31.02 
 
 		 581 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  35.44 
 
 		 607 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  28.97 
 
 		 591 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  29.26 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.83 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.74 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32 
 
 		 579 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.12 
 
 		 549 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  29.66 
 
 		 533 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  31.08 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  28.04 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  28.41 
 
 		 1087 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.94 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  31.49 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3249  serine phosphatase  32.4 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  26.48 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  28.12 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  31.22 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  29.38 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  28.41 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 		 583 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.51 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  32.28 
 
 		 723 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  28.46 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  28.46 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.54 
 
 		 1087 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  30.45 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  33.61 
 
 		 557 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.32 
 
 		 549 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  28.02 
 
 		 697 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  28.46 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  29.78 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  26.22 
 
 		 705 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.02 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  25.57 
 
 		 1079 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 		 692 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  29.27 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 		 652 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.03 
 
 		 1051 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  28.06 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  31.51 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  27.98 
 
 		 743 aa  69.7  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  31.66 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32 
 
 		 692 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  25.48 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  25.1 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  28.4 
 
 		 618 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  32.44 
 
 		 770 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.3 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.84 
 
 		 606 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.36 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.83 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.3 
 
 		 748 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  32.2 
 
 		 828 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  27.59 
 
 		 648 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  29.69 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  26.26 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.29 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  25.41 
 
 		 754 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.19 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.3 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2012  Stage II sporulation E family protein  30.3 
 
 		 612 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  30.87 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  30.53 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.68 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  27.31 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.78 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.8 
 
 		 1332 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.1 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>