More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1656 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1656  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  715    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2902  AraC family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000829875  normal  0.0371482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2406  AraC family transcriptional regulator  49.85 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0741804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1537  AraC family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2932  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1531  AraC family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00128514  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1471  AraC family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 339 aa  338  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2118  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0916318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  25.31 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 382 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 343 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  43.02 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  41.46 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4913  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  31.94 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2150  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.511846  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  27.32 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2197  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.536448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  27.73 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  25 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  25.42 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  42.68 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2010  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3351  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  normal  0.830085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  28.5 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  37.36 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2633  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4066  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.138885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  31.67 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2211  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3527  helix-turn-helix domain-containing protein  36.56 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  33.66 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  36.56 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>