More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2932 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2932  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 353 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1471  AraC family transcriptional regulator  85.25 
 
 		 339 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1531  AraC family transcriptional regulator  83.97 
 
 		 343 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00128514  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1537  AraC family transcriptional regulator  83.48 
 
 		 339 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2902  AraC family transcriptional regulator  50.15 
 
 		 341 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000829875  normal  0.0371482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1656  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 342 aa  339  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2406  AraC family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0741804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2118  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0916318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4147  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  39.78 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.31 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  43.82 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6814  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6273  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294899  normal  0.494705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1556  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1895  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375794  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  25.26 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2150  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.511846  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  24.53 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2080  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  42.5 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2519  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  31.17 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  31.1 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  31.1 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2234  helix-turn-helix domain-containing protein  44.3 
 
 		 99 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.440847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2609  HTH-type transcriptional regulator VqsM  39.56 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  28.72 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2125  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 130 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2205  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30620  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0924433 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2350  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2010  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  25.36 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>