More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1683 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 737 aa  1446    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  43.38 
 
 		 794 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  43.34 
 
 		 729 aa  485  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  41.51 
 
 		 743 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  40.53 
 
 		 846 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  40.39 
 
 		 743 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  40.82 
 
 		 847 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  37.3 
 
 		 744 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  37.48 
 
 		 736 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  37.09 
 
 		 745 aa  350  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.46 
 
 		 743 aa  277  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.13 
 
 		 983 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.13 
 
 		 983 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.63 
 
 		 979 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  34.17 
 
 		 718 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  31.21 
 
 		 740 aa  268  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  35.32 
 
 		 758 aa  263  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.86 
 
 		 735 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.06 
 
 		 737 aa  261  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  34.06 
 
 		 966 aa  253  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.75 
 
 		 717 aa  253  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  34.04 
 
 		 978 aa  253  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.48 
 
 		 738 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.93 
 
 		 711 aa  250  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  35.45 
 
 		 842 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.26 
 
 		 968 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.08 
 
 		 752 aa  244  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.64 
 
 		 741 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  35.2 
 
 		 723 aa  241  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.8 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  29.99 
 
 		 710 aa  238  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  31.07 
 
 		 734 aa  238  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  33.69 
 
 		 714 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  28.55 
 
 		 920 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.29 
 
 		 761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  34.98 
 
 		 728 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  31.25 
 
 		 732 aa  233  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.74 
 
 		 760 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.43 
 
 		 796 aa  231  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  33.95 
 
 		 731 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.28 
 
 		 758 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.04 
 
 		 735 aa  227  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.2 
 
 		 733 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  29.84 
 
 		 737 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  29.12 
 
 		 997 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.76 
 
 		 729 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  26.97 
 
 		 749 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  32.51 
 
 		 743 aa  224  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  28.89 
 
 		 761 aa  223  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.64 
 
 		 740 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  30.77 
 
 		 755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  29.38 
 
 		 829 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  29.38 
 
 		 829 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.46 
 
 		 781 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.73 
 
 		 743 aa  221  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  30.65 
 
 		 909 aa  221  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  29.84 
 
 		 734 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  29.99 
 
 		 793 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  30.98 
 
 		 854 aa  218  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.39 
 
 		 766 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  29.19 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  30.25 
 
 		 1002 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.96 
 
 		 832 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.5 
 
 		 723 aa  214  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  30.14 
 
 		 917 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.06 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  32.57 
 
 		 735 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.56 
 
 		 704 aa  211  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.66 
 
 		 724 aa  210  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.47 
 
 		 746 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  31.1 
 
 		 787 aa  209  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.64 
 
 		 757 aa  209  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  28.11 
 
 		 1013 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.01 
 
 		 750 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  29.73 
 
 		 738 aa  207  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  32.85 
 
 		 735 aa  207  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  30.49 
 
 		 736 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  28.99 
 
 		 738 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  31.67 
 
 		 715 aa  206  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36 
 
 		 743 aa  205  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  32.22 
 
 		 737 aa  205  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  32.63 
 
 		 903 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  31.79 
 
 		 762 aa  204  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  28.32 
 
 		 732 aa  203  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  30.29 
 
 		 718 aa  203  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  27.47 
 
 		 770 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  24.69 
 
 		 730 aa  201  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  28.69 
 
 		 734 aa  201  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  26.64 
 
 		 893 aa  200  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  24.69 
 
 		 730 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  31.89 
 
 		 745 aa  199  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  30.44 
 
 		 717 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  28.45 
 
 		 805 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  29.89 
 
 		 772 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  29.89 
 
 		 772 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  24.24 
 
 		 730 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  32.33 
 
 		 779 aa  197  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  29.89 
 
 		 772 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1092 aa  197  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  30.18 
 
 		 791 aa  197  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>