More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0931 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  80.2 
 
 		 227 aa  333  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  79.19 
 
 		 226 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  70.94 
 
 		 205 aa  298  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  69.5 
 
 		 200 aa  293  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  69.07 
 
 		 221 aa  284  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  64.73 
 
 		 211 aa  275  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 330 aa  271  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 216 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  64.08 
 
 		 218 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  65.7 
 
 		 207 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  64.22 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  64 
 
 		 218 aa  262  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  62.19 
 
 		 217 aa  261  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  61.08 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  62.02 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 197 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 197 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  64.1 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  61.39 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  63.4 
 
 		 317 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  61.69 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  60.59 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  54.19 
 
 		 220 aa  224  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 273 aa  220  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  55.78 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  46.05 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  27.14 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>