More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0454 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  100 
 
 
316 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  65.92 
 
 
304 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  64.45 
 
 
308 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  65.12 
 
 
356 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  64.03 
 
 
301 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  61.31 
 
 
313 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  58.63 
 
 
304 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  57 
 
 
391 aa  318  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  58.75 
 
 
304 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.33 
 
 
323 aa  300  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  44.64 
 
 
315 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.98 
 
 
317 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 
317 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.77 
 
 
317 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 
316 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.22 
 
 
314 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  45.79 
 
 
310 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  36.96 
 
 
310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.45 
 
 
309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  33.44 
 
 
313 aa  165  8e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.5 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33.12 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  33.12 
 
 
313 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.64 
 
 
302 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  40 
 
 
305 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
305 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  34.31 
 
 
329 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  35.54 
 
 
327 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  40.64 
 
 
317 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 
309 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  36.52 
 
 
235 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 
309 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
309 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  43.05 
 
 
332 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  36.43 
 
 
303 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  38.29 
 
 
303 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
334 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.79 
 
 
308 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  35.86 
 
 
326 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 
309 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  40.35 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  34.64 
 
 
304 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  39.17 
 
 
318 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
309 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  39.34 
 
 
315 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
287 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
319 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
244 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.87 
 
 
306 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  42.72 
 
 
301 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  36.52 
 
 
319 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
310 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  32.69 
 
 
311 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  40.32 
 
 
305 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  42.25 
 
 
303 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
309 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
360 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  30.48 
 
 
360 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.38 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.74 
 
 
353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  37.59 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
266 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  37.39 
 
 
260 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 
308 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  39.92 
 
 
298 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  39.81 
 
 
247 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40.76 
 
 
298 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.73 
 
 
305 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4550  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.07 
 
 
314 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  41.31 
 
 
300 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.97 
 
 
316 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  36.23 
 
 
248 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  35.96 
 
 
512 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  42.86 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.03 
 
 
301 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
309 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
279 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  44.75 
 
 
342 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  34.28 
 
 
323 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3948  ABC transporter related  41.26 
 
 
294 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.29 
 
 
312 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  30.59 
 
 
307 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.56 
 
 
334 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  40 
 
 
315 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.27 
 
 
411 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
287 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  34.69 
 
 
306 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
312 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 
356 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.94 
 
 
303 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  40.09 
 
 
331 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  42.33 
 
 
320 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.56 
 
 
317 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  39.05 
 
 
340 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
309 aa  149  6e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.3 
 
 
312 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  39.04 
 
 
316 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.71 
 
 
309 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  36.86 
 
 
309 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>