158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1202 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  100 
 
 		 346 aa  696    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0865  integrase family protein  35.46 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0912  integrase family protein  35.26 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  33.43 
 
 		 344 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  31.59 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.3 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  22.08 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  30.08 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  22.7 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  28 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  25.15 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  23.98 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  23.98 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.12 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  25.14 
 
 		 370 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  27.85 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  31.79 
 
 		 619 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  23.46 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  22.84 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  32.16 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  23.95 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  23.28 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  23.45 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  23.28 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.3 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  22.73 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  33.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  25.66 
 
 		 527 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  23.73 
 
 		 477 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.62 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  23.29 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  23.29 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  23.27 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 282 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  24.34 
 
 		 508 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  24.34 
 
 		 508 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  23.43 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  24.35 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.15 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.95 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  28 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  27.54 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  21.03 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  23.55 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  22.16 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.05 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  19.73 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  22.16 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  22.16 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.85 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  26.86 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  23.11 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  21.47 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  24.84 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  20.71 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  21.83 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.88 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.86 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  23.02 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0624  integrase family protein  21.28 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  28.66 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  28.66 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.46 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  21.18 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  21.2 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3686  putative phage integrase  22.81 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  24.32 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  23.11 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  28.4 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  28.4 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  24.4 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  24.16 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  24.85 
 
 		 480 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  27.45 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  19.31 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.17 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  22.81 
 
 		 471 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  26.79 
 
 		 386 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  23.75 
 
 		 403 aa  46.2  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  21.97 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  25.66 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  23.81 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  21.49 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  20.56 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  20.85 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  22.32 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  20.91 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  20.11 
 
 		 438 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  20.89 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>