More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2162 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2162  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.637504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  39.64 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  35.1 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  39.22 
 
 		 141 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.86 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2022  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00965402  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5280  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  26.97 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  32.58 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  45.35 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  39.8 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  25.95 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6896  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 112 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 144 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  35 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  34.95 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  38.78 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  38.14 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  36.89 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  41.67 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  26.37 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>