61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4733 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1053    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  58.73 
 
 		 521 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  48.61 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  51.63 
 
 		 523 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  36.71 
 
 		 524 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  35.5 
 
 		 517 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  29.68 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.65 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  32.48 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  29.46 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.32 
 
 		 1126 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.12 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  26.19 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  28.96 
 
 		 1088 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  30.2 
 
 		 1109 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  22.8 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  27.46 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.5 
 
 		 3197 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.73 
 
 		 1129 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.51 
 
 		 1009 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.36 
 
 		 3197 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1127 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27.01 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  25.76 
 
 		 974 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.6 
 
 		 1222 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.8 
 
 		 1275 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  28.22 
 
 		 681 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.65 
 
 		 1490 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.22 
 
 		 1114 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32.79 
 
 		 813 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  23.74 
 
 		 1557 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  28.14 
 
 		 1172 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.91 
 
 		 11716 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  29.55 
 
 		 412 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  32.14 
 
 		 1161 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 1113 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  28.67 
 
 		 508 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.32 
 
 		 1208 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  24.15 
 
 		 828 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  30.28 
 
 		 1127 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.69 
 
 		 604 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  25.68 
 
 		 664 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.74 
 
 		 1170 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.18 
 
 		 1189 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.67 
 
 		 546 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.39 
 
 		 803 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.44 
 
 		 1066 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.34 
 
 		 891 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.41 
 
 		 1236 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.57 
 
 		 1225 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.71 
 
 		 1019 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  28.02 
 
 		 1113 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.42 
 
 		 2807 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.95 
 
 		 1228 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 1340 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  26.26 
 
 		 616 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  30.52 
 
 		 1208 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1289 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.26 
 
 		 1118 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.04 
 
 		 8871 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>