73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4417 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  100 
 
 		 485 aa  1007    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  52.99 
 
 		 484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  35.04 
 
 		 489 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  62.75 
 
 		 274 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  55.88 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  57.14 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  47.83 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  47.12 
 
 		 150 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  50 
 
 		 506 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  40.34 
 
 		 668 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  50.53 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  42.48 
 
 		 804 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  46.46 
 
 		 156 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  41.75 
 
 		 230 aa  93.2  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  47.12 
 
 		 279 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  41.18 
 
 		 275 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  46.08 
 
 		 156 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  41.03 
 
 		 288 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  45.63 
 
 		 279 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  42.27 
 
 		 143 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  40.62 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  38.74 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40.78 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  40 
 
 		 604 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  41.67 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  37.11 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  36.44 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  42.17 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  43.21 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  37.78 
 
 		 583 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  40.22 
 
 		 172 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  33.33 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  35.42 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35.71 
 
 		 238 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  30.4 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  33.73 
 
 		 230 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  32.67 
 
 		 276 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  33.73 
 
 		 232 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  32.29 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  37.35 
 
 		 212 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  36.14 
 
 		 225 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  32.53 
 
 		 233 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  32.53 
 
 		 233 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  32.53 
 
 		 233 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  34.48 
 
 		 250 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  38.96 
 
 		 231 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  33.33 
 
 		 212 aa  50.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  26.23 
 
 		 122 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.06 
 
 		 112 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  32.95 
 
 		 295 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  39.29 
 
 		 236 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  31.65 
 
 		 273 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  35.71 
 
 		 236 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  29.03 
 
 		 223 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  37.04 
 
 		 275 aa  47  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  32.05 
 
 		 271 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  35 
 
 		 221 aa  47  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  35 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  29.31 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  35.71 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  32.05 
 
 		 268 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  35 
 
 		 263 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  25.56 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  35.8 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  28.74 
 
 		 233 aa  45.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.33 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  30.77 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 267 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  31.11 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.62 
 
 		 277 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  35.9 
 
 		 266 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  34.15 
 
 		 239 aa  43.9  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>