More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2867 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 399 aa  811    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  45.48 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  47 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  40.81 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  45.1 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  42.18 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  43.65 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  39.57 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  39.92 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  43.78 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  32.75 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  42.27 
 
 		 342 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  39.64 
 
 		 1021 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  44.39 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  38.36 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  32.3 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  42.34 
 
 		 339 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  41.26 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  40.1 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  41 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  40.48 
 
 		 345 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  40.5 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  36.96 
 
 		 523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  43.28 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  39.19 
 
 		 357 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  39.02 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  35.92 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  38.39 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  39.38 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  39.9 
 
 		 339 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  43.75 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  38.3 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  35.42 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  34.9 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 		 366 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  34.96 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  34.91 
 
 		 356 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  31.53 
 
 		 347 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  34.21 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  38.86 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  33.17 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  38.14 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  30.53 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  32.71 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  30.59 
 
 		 578 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  31.78 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  34.09 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.49 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  35.96 
 
 		 360 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  32.89 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  29.09 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  32.76 
 
 		 1016 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  34.83 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  30.67 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  30.46 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 586 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  32.99 
 
 		 336 aa  86.3  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  30.05 
 
 		 455 aa  86.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  27.35 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 		 831 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  29.69 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  37.5 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  26.78 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  34.41 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  27.67 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  37.5 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  36.71 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  33.71 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  33.62 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  36.72 
 
 		 559 aa  83.2  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  33.71 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  33.14 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  34.1 
 
 		 355 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  36.08 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  31.71 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  34.3 
 
 		 589 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  29.44 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  35.06 
 
 		 591 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  31.46 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>