More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0841 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  56.05 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  35.89 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  35.74 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  33.07 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  32.8 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 		 250 aa  121  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  31.37 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  30.24 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  32.64 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  26.51 
 
 		 251 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3442  transcriptional regulator, DeoR family  35.2 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000177835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  32.11 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  29.34 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  31.9 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  32.39 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  27.71 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  30.68 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  28.4 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.39 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  30.93 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  29.46 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4674  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  29.34 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  27.92 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  29.03 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  29.55 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  28.11 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  29.8 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  30.21 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  25.7 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  30.38 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  29.52 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  29.52 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.19 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  31.49 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003595  transcriptional repressor of aga operon  28.15 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  29.52 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  28.1 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  29.75 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  30.58 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  30.57 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  28.74 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  31.12 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>