252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  100 
 
 
418 aa  813    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  47.46 
 
 
423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  44.82 
 
 
448 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  45.78 
 
 
415 aa  263  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  41.97 
 
 
451 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  38.76 
 
 
407 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  35.29 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  36.39 
 
 
433 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  30.59 
 
 
468 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  31.86 
 
 
438 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  39.76 
 
 
394 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  31.07 
 
 
425 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  38.77 
 
 
413 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  32.17 
 
 
428 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.61 
 
 
410 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  40.33 
 
 
413 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  34.81 
 
 
436 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  33.57 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  35.57 
 
 
414 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  33.7 
 
 
455 aa  151  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  28.93 
 
 
470 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  31.31 
 
 
437 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  32.3 
 
 
420 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  34.49 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  31.37 
 
 
431 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  38.12 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  32.3 
 
 
446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  31.86 
 
 
418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.68 
 
 
464 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  31.95 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  30.21 
 
 
492 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.6 
 
 
454 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  31.11 
 
 
456 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  22.73 
 
 
647 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  29.52 
 
 
469 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  51.67 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  31.78 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  28.03 
 
 
498 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  28.03 
 
 
498 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  25.88 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 
346 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  39.51 
 
 
537 aa  56.6  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  43.75 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.61 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  50 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  44.29 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  26.52 
 
 
463 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 
490 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  21 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  40.79 
 
 
456 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  27.24 
 
 
472 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  25.46 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  47.17 
 
 
469 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  28.32 
 
 
532 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  21.9 
 
 
464 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  43.14 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  48.39 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  48.39 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  45.1 
 
 
468 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.57 
 
 
492 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  49.02 
 
 
436 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  26.56 
 
 
667 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  52 
 
 
445 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  47.06 
 
 
479 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  30.43 
 
 
502 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 
330 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  30.43 
 
 
502 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  48.48 
 
 
498 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  47.06 
 
 
476 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  49.02 
 
 
657 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25.79 
 
 
451 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  28.05 
 
 
400 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  44.78 
 
 
447 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  25.44 
 
 
415 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  37.84 
 
 
465 aa  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  41.18 
 
 
448 aa  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
470 aa  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  32.43 
 
 
645 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  41.18 
 
 
245 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.54 
 
 
647 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  38.89 
 
 
467 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.54 
 
 
647 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  27.24 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  26.57 
 
 
494 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  24.17 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  32.11 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  36.92 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  37.8 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  46.97 
 
 
493 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  46.97 
 
 
493 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 
554 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  27.24 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  46.97 
 
 
493 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  42.11 
 
 
459 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  37.68 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  37.7 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  36.78 
 
 
556 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>