More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  63.49 
 
 		 748 aa  758    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10400  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 822 aa  1648    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1345  glycogen debranching enzyme GlgX  61.69 
 
 		 756 aa  686    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  57.73 
 
 		 771 aa  847    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  66.24 
 
 		 738 aa  773    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  49.01 
 
 		 720 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  52.04 
 
 		 704 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0857  glycogen debranching enzyme GlgX  54.68 
 
 		 703 aa  555  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2978  glycogen debranching enzyme GlgX  40.53 
 
 		 850 aa  545  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  40.98 
 
 		 710 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  42.68 
 
 		 712 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  42.42 
 
 		 712 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  47.38 
 
 		 830 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19030  glycogen debranching enzyme GlgX  53.71 
 
 		 747 aa  528  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1695  pullulanase-like glycosidase  42.47 
 
 		 846 aa  523  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  39.67 
 
 		 722 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  36.55 
 
 		 718 aa  511  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  40.54 
 
 		 716 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  42.62 
 
 		 712 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  46.73 
 
 		 707 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  40.14 
 
 		 733 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  40.59 
 
 		 716 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  47.3 
 
 		 730 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  44.18 
 
 		 720 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  40.3 
 
 		 704 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  47.02 
 
 		 708 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  44.75 
 
 		 706 aa  494  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  48.66 
 
 		 701 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  39.09 
 
 		 733 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  48.36 
 
 		 701 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  46.69 
 
 		 712 aa  491  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  44.98 
 
 		 714 aa  492  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  45.4 
 
 		 704 aa  489  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  47.2 
 
 		 727 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  46.21 
 
 		 720 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  47.83 
 
 		 701 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.98 
 
 		 720 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  48.03 
 
 		 706 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  48.84 
 
 		 709 aa  489  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  46.65 
 
 		 717 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  47.5 
 
 		 727 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  45.47 
 
 		 711 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  43.5 
 
 		 709 aa  482  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  47.17 
 
 		 723 aa  486  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  47.8 
 
 		 721 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  48.65 
 
 		 713 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  46.83 
 
 		 717 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  46.4 
 
 		 719 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  45.58 
 
 		 721 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  46.83 
 
 		 717 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  44.19 
 
 		 751 aa  482  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  48.58 
 
 		 700 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  44.32 
 
 		 715 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  40.47 
 
 		 754 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  45.85 
 
 		 729 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  48.08 
 
 		 719 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  38.34 
 
 		 728 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  47.12 
 
 		 720 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  46.65 
 
 		 717 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  44.9 
 
 		 720 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  42.68 
 
 		 752 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  46.28 
 
 		 701 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  44.9 
 
 		 722 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  48.49 
 
 		 703 aa  475  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  45.99 
 
 		 720 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  50.2 
 
 		 1537 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09570  glycogen debranching enzyme GlgX  51 
 
 		 732 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213931  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  45.97 
 
 		 718 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  44.9 
 
 		 720 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  51.21 
 
 		 776 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  47.79 
 
 		 719 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  46.77 
 
 		 715 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  45.9 
 
 		 711 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  45.71 
 
 		 733 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  44.21 
 
 		 723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  45.02 
 
 		 721 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  45.31 
 
 		 718 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  48.24 
 
 		 721 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  46.36 
 
 		 714 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  46.18 
 
 		 701 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  44.95 
 
 		 738 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  48.19 
 
 		 705 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  48.19 
 
 		 705 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  44.35 
 
 		 710 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  48.19 
 
 		 705 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 		 738 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  45.47 
 
 		 727 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  49.43 
 
 		 708 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  44.77 
 
 		 704 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  45.11 
 
 		 755 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  46.27 
 
 		 712 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  42 
 
 		 708 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  45.88 
 
 		 1464 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3089  glycogen debranching enzyme GlgX  47.79 
 
 		 734 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000640633  hitchhiker  0.0000151217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  39.24 
 
 		 766 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  42.16 
 
 		 714 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  40.94 
 
 		 688 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.06 
 
 		 711 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  44.74 
 
 		 756 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  45.24 
 
 		 703 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>