More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09570 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09570  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 732 aa  1458    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213931  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  47.12 
 
 		 700 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  46.32 
 
 		 748 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  49.71 
 
 		 738 aa  547  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  47.38 
 
 		 720 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  47.38 
 
 		 771 aa  534  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  47.54 
 
 		 707 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  48.97 
 
 		 709 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  48.12 
 
 		 718 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  45.4 
 
 		 706 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  43.85 
 
 		 712 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1345  glycogen debranching enzyme GlgX  47.23 
 
 		 756 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  44.59 
 
 		 701 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  44.27 
 
 		 710 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  43.82 
 
 		 712 aa  509  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  47.88 
 
 		 701 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  45.91 
 
 		 720 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  45.05 
 
 		 716 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  44.67 
 
 		 721 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  43.99 
 
 		 713 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  43.2 
 
 		 708 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.81 
 
 		 711 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  43.12 
 
 		 720 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  43.63 
 
 		 717 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  43.65 
 
 		 711 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  43.29 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 		 720 aa  502  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  43.63 
 
 		 717 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  43.64 
 
 		 721 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  45.13 
 
 		 716 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19030  glycogen debranching enzyme GlgX  45.72 
 
 		 747 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  43.12 
 
 		 722 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  42.68 
 
 		 714 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  42.88 
 
 		 707 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  44.43 
 
 		 704 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  43.12 
 
 		 720 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  42.68 
 
 		 714 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  40.54 
 
 		 714 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 715 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  45.73 
 
 		 712 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  48.71 
 
 		 830 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  43.32 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  43.63 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  46.54 
 
 		 711 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  46.29 
 
 		 712 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  42.73 
 
 		 718 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  46.25 
 
 		 703 aa  499  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  42.47 
 
 		 723 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  48.45 
 
 		 709 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2939  glycogen debranching enzyme GlgX  48.04 
 
 		 707 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  43.43 
 
 		 727 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  45.45 
 
 		 706 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  43.87 
 
 		 704 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  44.55 
 
 		 719 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  45.04 
 
 		 705 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  45.09 
 
 		 715 aa  494  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0857  glycogen debranching enzyme GlgX  44.07 
 
 		 703 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  45.04 
 
 		 705 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  43.16 
 
 		 721 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  43.4 
 
 		 1464 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  44.57 
 
 		 722 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  43.53 
 
 		 727 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  46.19 
 
 		 712 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  40.74 
 
 		 706 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  45.6 
 
 		 757 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  44.82 
 
 		 708 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  44.18 
 
 		 720 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  44.95 
 
 		 779 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  43.18 
 
 		 701 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  40.83 
 
 		 709 aa  489  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 733 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  45.12 
 
 		 705 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  43.89 
 
 		 730 aa  489  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  44.09 
 
 		 743 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  44.44 
 
 		 708 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  41.42 
 
 		 710 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.81 
 
 		 701 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 		 720 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  44.83 
 
 		 727 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 		 758 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  43.05 
 
 		 720 aa  489  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  43.47 
 
 		 701 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  42.47 
 
 		 751 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  43.86 
 
 		 745 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  43.44 
 
 		 755 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 		 758 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  43.07 
 
 		 756 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  42.29 
 
 		 733 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  39.75 
 
 		 733 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  42.44 
 
 		 729 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  44.52 
 
 		 733 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  51.12 
 
 		 802 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  43.67 
 
 		 719 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  42.14 
 
 		 733 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  42.14 
 
 		 733 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  43.45 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  44.81 
 
 		 755 aa  485  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  44.29 
 
 		 708 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  41.11 
 
 		 710 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  42.29 
 
 		 733 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>