140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3749 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  92.51 
 
 		 188 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  89.89 
 
 		 200 aa  343  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  82.07 
 
 		 197 aa  316  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  75.4 
 
 		 207 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  75.81 
 
 		 207 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  74.73 
 
 		 207 aa  290  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  68.65 
 
 		 201 aa  276  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  76.16 
 
 		 181 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  60.33 
 
 		 223 aa  225  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  59.46 
 
 		 197 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  59.77 
 
 		 174 aa  214  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  47.59 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  51.61 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  46.8 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  48.68 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  41.28 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  40.68 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  35.36 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  36.07 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  37.77 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  40.43 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  39.27 
 
 		 199 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  37.57 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  39.15 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  36.99 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  41.48 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  37.7 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  37.37 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  37.17 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  40.91 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  34.24 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  36.32 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  36.22 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  34.12 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  37.43 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  36.94 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  33.51 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  35 
 
 		 243 aa  88.6  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  32.57 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  32.98 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  33.69 
 
 		 243 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  34.41 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  32.28 
 
 		 237 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  31.91 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  32.28 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  32.47 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  34.39 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  31.03 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  31.02 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  31.91 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  32.45 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  30.48 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  29.14 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  31.32 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  30.53 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  25.84 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  28.73 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  34.52 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  28.1 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  28.25 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  24.55 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  28.25 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  28.25 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  28.25 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  26.14 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  26.11 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  26.26 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  28.88 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  28.07 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  28.14 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  23.86 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  23.86 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  27.63 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  27.01 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  23.3 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  27.45 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  23.08 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  26.97 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  26.97 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  30.64 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  23.86 
 
 		 253 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  27.45 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  24.43 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  27.53 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  28.49 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  28.9 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  28.49 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  23.56 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  25.66 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  29.61 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  23.2 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  24.18 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  27.91 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  26.9 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  27.45 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  26.63 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  25.66 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  27.45 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>