249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2896 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  90.93 
 
 		 554 aa  1021    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.68 
 
 		 541 aa  720    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.76 
 
 		 572 aa  743    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  85.05 
 
 		 557 aa  962    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  86.27 
 
 		 559 aa  962    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  85.11 
 
 		 557 aa  964    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  70.09 
 
 		 558 aa  780    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 562 aa  1152    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  98.75 
 
 		 562 aa  1138    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.07 
 
 		 557 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  69.91 
 
 		 538 aa  722    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  85.11 
 
 		 557 aa  962    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  97.51 
 
 		 562 aa  1102    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  85.28 
 
 		 557 aa  965    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.76 
 
 		 587 aa  744    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.17 
 
 		 613 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  40.55 
 
 		 584 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  42.12 
 
 		 549 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.72 
 
 		 562 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  38.87 
 
 		 538 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  38.52 
 
 		 541 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  38.38 
 
 		 529 aa  356  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  64.81 
 
 		 563 aa  353  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  39.57 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.37 
 
 		 589 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  38.91 
 
 		 563 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  58.25 
 
 		 303 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  39.55 
 
 		 570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  49.7 
 
 		 505 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.62 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.09 
 
 		 577 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.09 
 
 		 580 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.43 
 
 		 556 aa  296  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  51.13 
 
 		 563 aa  296  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.15 
 
 		 562 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.68 
 
 		 536 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 564 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  34.92 
 
 		 540 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  55.16 
 
 		 257 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.45 
 
 		 562 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  49.81 
 
 		 291 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  49.81 
 
 		 291 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.7 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  47.41 
 
 		 271 aa  247  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.9 
 
 		 536 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  35.5 
 
 		 390 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  42.28 
 
 		 498 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  41.53 
 
 		 302 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  46.56 
 
 		 302 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  39.41 
 
 		 385 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  43.54 
 
 		 302 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  43.54 
 
 		 302 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  46.18 
 
 		 302 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  41.11 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  40.23 
 
 		 392 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  40.96 
 
 		 300 aa  207  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  38.3 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  43.25 
 
 		 308 aa  206  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.11 
 
 		 395 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  39.64 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.36 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  40.6 
 
 		 302 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.36 
 
 		 372 aa  204  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  42.21 
 
 		 302 aa  202  9e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  34.03 
 
 		 422 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  41.84 
 
 		 310 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  34.67 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  42.7 
 
 		 309 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  43.17 
 
 		 267 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  40.96 
 
 		 334 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  44.66 
 
 		 310 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  43.4 
 
 		 296 aa  198  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  42.35 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  42.65 
 
 		 302 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  35.16 
 
 		 439 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  43.48 
 
 		 300 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  43.18 
 
 		 267 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  41.69 
 
 		 304 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  35.4 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  38.83 
 
 		 388 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.45 
 
 		 353 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  39.31 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  43.75 
 
 		 300 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  39.39 
 
 		 302 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  42.91 
 
 		 275 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  40.15 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  34.39 
 
 		 427 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  40.71 
 
 		 371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  39.53 
 
 		 301 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  41.83 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  38.2 
 
 		 368 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  39.78 
 
 		 266 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  36.59 
 
 		 341 aa  189  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  45.82 
 
 		 314 aa  189  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  36.7 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  36.82 
 
 		 357 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  43.2 
 
 		 437 aa  187  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  37.92 
 
 		 266 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  38.46 
 
 		 532 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  40.75 
 
 		 281 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>