267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2612 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  81.2 
 
 		 381 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  86.72 
 
 		 399 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  81.46 
 
 		 381 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  81.46 
 
 		 381 aa  646    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  96 
 
 		 400 aa  776    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  95.5 
 
 		 400 aa  773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  100 
 
 		 400 aa  813    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  81.2 
 
 		 381 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  83.03 
 
 		 381 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  73.37 
 
 		 380 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  72.54 
 
 		 381 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  70.73 
 
 		 381 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  71.8 
 
 		 381 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  59.9 
 
 		 381 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  51.71 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  51.05 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  50.39 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  45.08 
 
 		 381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  44.56 
 
 		 383 aa  325  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  46.17 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  39.43 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  37.31 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  38.32 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  38.07 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  38.07 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  38.07 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  38.07 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  37.82 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  37.56 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  37.56 
 
 		 385 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  36.13 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  34.54 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  35.6 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  37.56 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  32.9 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  32.9 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  39.48 
 
 		 379 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  32.3 
 
 		 374 aa  229  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  39.88 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  34.72 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  33.59 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  40.91 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  36.34 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  37.1 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  35.64 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.62 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.92 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  36.29 
 
 		 375 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.46 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  38.25 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  32.6 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  32.9 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  38.99 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.51 
 
 		 418 aa  195  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  34.65 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  30.11 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  32.6 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  37.57 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  36.53 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  35.92 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  28.5 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  32.63 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  29.14 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  31.25 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  37.01 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  34.01 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  31.93 
 
 		 406 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  31.73 
 
 		 412 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  29.44 
 
 		 425 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.64 
 
 		 435 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  27.01 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  34.97 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  30.57 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  31.49 
 
 		 408 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  31.1 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  30.13 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  29.77 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  28.11 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  24.68 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  24.68 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  35.71 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  29.94 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  35.26 
 
 		 406 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.83 
 
 		 418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  28.92 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  30.79 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  26.09 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  27.59 
 
 		 442 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  28.67 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  28.86 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  28.86 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  28.86 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  28.86 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  28.86 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  28.86 
 
 		 400 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  30.89 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  30.51 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  30.19 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  26.95 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  29.87 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>