260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  100 
 
 		 381 aa  784    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  45.79 
 
 		 375 aa  358  9e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  40.36 
 
 		 388 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  37.66 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  38.03 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  39.5 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  36.98 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  37.17 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  37.17 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  34.46 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  37.23 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  37.08 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  36.91 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  36.91 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.34 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  36.94 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.62 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  34.66 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.99 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.99 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  35.04 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  36.25 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  35.49 
 
 		 385 aa  215  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  35.17 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  34.91 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  34.91 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  34.91 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  34.91 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  38.72 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  36.36 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  35.06 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  35.32 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  37.2 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  34.46 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  30.87 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.98 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  35.53 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  31.2 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  33.68 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  28.46 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  34.19 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.16 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  32.54 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  34.38 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  33.53 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  34.74 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  28.38 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  28.38 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  36.55 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.94 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.78 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  32.23 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  32.48 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  30.79 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.54 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.98 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  26.33 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  31.56 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.24 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  32.71 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.61 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  29.6 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  29.46 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  28.35 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  29.71 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  29.5 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  29.62 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  25.53 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  27.65 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  29.34 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  28.75 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  28.75 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.57 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  29.38 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  28.97 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  32.03 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  30.14 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  30.19 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  31.19 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  29.39 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  29.7 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  27.11 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  27.39 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  26.47 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  29.86 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  29.61 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.14 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.98 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  26.13 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  27.33 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  30.03 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  30.8 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  29.33 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  27.24 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  30.06 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  28.47 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  29.06 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>