More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1083 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  76.17 
 
 		 236 aa  367  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  71.93 
 
 		 238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  73.45 
 
 		 251 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  69.91 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  73.54 
 
 		 232 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  68.56 
 
 		 235 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  71.56 
 
 		 233 aa  317  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  69.91 
 
 		 255 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  69.96 
 
 		 256 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  69.96 
 
 		 256 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  69.78 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  71.69 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  61.88 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  64.89 
 
 		 233 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  64 
 
 		 233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  68.81 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  66.37 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  57.4 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  65.7 
 
 		 211 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  56.76 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  58.11 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.91 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  54.71 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  55.46 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 236 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  57.08 
 
 		 707 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  54.87 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 241 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  54.59 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  52.47 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  58.3 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  58.3 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  55.16 
 
 		 230 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.47 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  54.67 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  55.17 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  53.92 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  56.76 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  52.42 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  55.61 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  53.6 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.84 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  51.33 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  55.65 
 
 		 256 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  53.18 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  51.77 
 
 		 247 aa  241  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.45 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.88 
 
 		 266 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  52.61 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  52.19 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.47 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.7 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  57.21 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  50.22 
 
 		 249 aa  238  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  53.12 
 
 		 644 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  57.4 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  53.33 
 
 		 239 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  51.11 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  55.11 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  50.9 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  53.74 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  58.85 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  50.22 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.02 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  54.09 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  51.34 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  52.44 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  52.91 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  53.78 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  52.94 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  49.58 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  51.33 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  52.23 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  52.97 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  51.53 
 
 		 715 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  49.12 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  50.22 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  53.6 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  53.33 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  49.34 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  54.67 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  52 
 
 		 657 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  54.63 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  48.9 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  52.51 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  48.88 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  51.8 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>