226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0884 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  100 
 
 		 318 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  64.47 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  37.41 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  37.06 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 536 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  38.4 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  36.63 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.02 
 
 		 562 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  35.6 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  37.97 
 
 		 540 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.73 
 
 		 532 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  36.12 
 
 		 498 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 558 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  35.88 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.99 
 
 		 587 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 564 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.46 
 
 		 538 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.43 
 
 		 536 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  36.76 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  35.97 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.19 
 
 		 536 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  33.58 
 
 		 505 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  34.33 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 541 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 538 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  33.71 
 
 		 541 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  32.27 
 
 		 422 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.77 
 
 		 613 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  35.25 
 
 		 563 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 572 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  32.95 
 
 		 563 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.93 
 
 		 559 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  32.76 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  35.93 
 
 		 554 aa  156  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.46 
 
 		 372 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  38.4 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 		 557 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 		 557 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 		 557 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.93 
 
 		 562 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.93 
 
 		 562 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.93 
 
 		 562 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  33.73 
 
 		 584 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  33.45 
 
 		 563 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.45 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.2 
 
 		 557 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.8 
 
 		 562 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 568 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  30.71 
 
 		 392 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  35.92 
 
 		 549 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  31.23 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.2 
 
 		 577 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  34.44 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.75 
 
 		 580 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  35.5 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  33.33 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  32.84 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  34.8 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  34.18 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 589 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 562 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  35.56 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  35.19 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  32.96 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  29.39 
 
 		 393 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  32.06 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  32.64 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  35.21 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  34.07 
 
 		 529 aa  142  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  31.88 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  31.6 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  35.34 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  32.72 
 
 		 427 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  33.2 
 
 		 519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  36.78 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  31.75 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  33.71 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  34.8 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  32.35 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 556 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  32.82 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  31.33 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  30.55 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  35.25 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  32.4 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  32.44 
 
 		 267 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  33.2 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  31.72 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  31.25 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  33.6 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  33.6 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  32.06 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  34.84 
 
 		 570 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  32.17 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  30.16 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  32.82 
 
 		 284 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  33.2 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  32.85 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  30.55 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  30.16 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>