More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1436 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  86.57 
 
 		 1029 aa  1762    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  53.72 
 
 		 1036 aa  1107    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  43.88 
 
 		 1056 aa  875    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  51.55 
 
 		 1016 aa  1005    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  39.29 
 
 		 1012 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1017 aa  803    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  43.18 
 
 		 1013 aa  810    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  74.07 
 
 		 1024 aa  1514    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  74.46 
 
 		 1025 aa  1536    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  53.63 
 
 		 1032 aa  1102    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  86.57 
 
 		 1029 aa  1762    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  52.99 
 
 		 1028 aa  1087    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  48.57 
 
 		 1041 aa  969    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  52.3 
 
 		 1025 aa  1114    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  41.85 
 
 		 1040 aa  845    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  50.05 
 
 		 1028 aa  954    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  47.64 
 
 		 1010 aa  964    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1019 aa  855    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  50.49 
 
 		 1025 aa  1017    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  52.59 
 
 		 1019 aa  1087    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  51.91 
 
 		 1019 aa  1081    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.73 
 
 		 1014 aa  753    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1014 aa  797    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  50.93 
 
 		 1023 aa  1056    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  54.4 
 
 		 1021 aa  1117    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  42.8 
 
 		 1016 aa  762    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1028 aa  954    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  52.53 
 
 		 1024 aa  1068    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  47.74 
 
 		 1020 aa  967    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  86.47 
 
 		 1029 aa  1757    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.24 
 
 		 1016 aa  843    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  84.99 
 
 		 1029 aa  1721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  84.99 
 
 		 1029 aa  1721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  53.57 
 
 		 1036 aa  1114    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  40.86 
 
 		 1013 aa  755    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  73.78 
 
 		 1028 aa  1568    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1021 aa  2066    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  85 
 
 		 1027 aa  1719    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  51.27 
 
 		 1029 aa  1029    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  49.95 
 
 		 1028 aa  950    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  43.75 
 
 		 1043 aa  819    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  39.82 
 
 		 1017 aa  742    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.52 
 
 		 1013 aa  807    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  86.27 
 
 		 1029 aa  1748    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  53.14 
 
 		 1015 aa  1065    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  73.67 
 
 		 1028 aa  1530    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  85.17 
 
 		 1027 aa  1727    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  44.29 
 
 		 1009 aa  865    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  35.43 
 
 		 1027 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  35.94 
 
 		 1020 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  35.39 
 
 		 1035 aa  618  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  35.39 
 
 		 1035 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1035 aa  592  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.78 
 
 		 1019 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  33.3 
 
 		 1025 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1022 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1053 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  34.18 
 
 		 1019 aa  567  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1051 aa  565  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.15 
 
 		 1027 aa  556  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1050 aa  555  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1071 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1047 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1067 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1036 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1060 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  32.01 
 
 		 1041 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1048 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1048 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1048 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1049 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1049 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.01 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1047 aa  546  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1039 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1047 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1054 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1047 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1039 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1050 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1089 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  31.52 
 
 		 1045 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1044 aa  542  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1042 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1040 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1041 aa  539  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.57 
 
 		 1022 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 		 1018 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1046 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.19 
 
 		 1056 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.19 
 
 		 1056 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1046 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1045 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1046 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1036 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.19 
 
 		 1056 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1023 aa  532  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.49 
 
 		 1024 aa  532  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1018 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.29 
 
 		 1024 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>