101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2273 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  100 
 
 		 116 aa  239  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  95.69 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  75 
 
 		 116 aa  189  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  53.39 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  44.83 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  46.61 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  61.19 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  42.37 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  40.37 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  48.05 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  36.97 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  37.21 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  36.97 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  36.13 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  36.13 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  52.38 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  35.25 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  53.7 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3802  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3875  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4314  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0932405  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  33.63 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  40 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  40 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  33.06 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  38.14 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  57.78 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  41.89 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  42.5 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  31.54 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  37.1 
 
 		 585 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2241  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  40 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  41.43 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  38.82 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  43.08 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3259  HNH endonuclease  32.35 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  32.48 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  43.33 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 552 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  36.36 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  40 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 459 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  37.68 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  40.3 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2101  HNH nuclease  50 
 
 		 576 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  36.21 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  35 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  32.38 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  38.98 
 
 		 560 aa  42  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  35 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  44.68 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  34.21 
 
 		 260 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  35 
 
 		 165 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  37.93 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4626  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  39.13 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  32.76 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  44.93 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2249  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2895  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896232 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  35 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.98 
 
 		 596 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  36.23 
 
 		 435 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  36.21 
 
 		 177 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  47.06 
 
 		 454 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>