72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4502 on replicon NC_011665
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  94.54 
 
 		 862 aa  1684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  94.77 
 
 		 862 aa  1687    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  95.24 
 
 		 862 aa  1693    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  94.66 
 
 		 862 aa  1686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  95.12 
 
 		 862 aa  1692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  100 
 
 		 862 aa  1801    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  55.07 
 
 		 843 aa  974    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  29.49 
 
 		 866 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  31.44 
 
 		 865 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  28.5 
 
 		 858 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  26.29 
 
 		 875 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  26.18 
 
 		 874 aa  250  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  24.16 
 
 		 864 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  23.59 
 
 		 868 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  24.46 
 
 		 864 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  23.18 
 
 		 847 aa  205  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  24.76 
 
 		 827 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  22.59 
 
 		 815 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  24.29 
 
 		 860 aa  172  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  23.66 
 
 		 815 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  24.42 
 
 		 855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  24.81 
 
 		 855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  23.17 
 
 		 815 aa  164  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  25.51 
 
 		 809 aa  164  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  28.45 
 
 		 690 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  24.13 
 
 		 866 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.51 
 
 		 894 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.08 
 
 		 860 aa  101  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  20.86 
 
 		 816 aa  99.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  28.78 
 
 		 845 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  27.86 
 
 		 841 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.58 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  26.56 
 
 		 819 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.02 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.34 
 
 		 792 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.95 
 
 		 629 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.69 
 
 		 861 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  25.52 
 
 		 845 aa  72  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.33 
 
 		 608 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  24.93 
 
 		 843 aa  71.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.27 
 
 		 837 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.47 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.76 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  22.8 
 
 		 908 aa  65.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.62 
 
 		 630 aa  65.1  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  25.4 
 
 		 938 aa  61.2  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.38 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  19.34 
 
 		 699 aa  58.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  22.02 
 
 		 913 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  20.85 
 
 		 699 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  20.85 
 
 		 699 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.27 
 
 		 913 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  20.79 
 
 		 616 aa  52  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1002 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  23.51 
 
 		 866 aa  51.2  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0826  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1734 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  23.85 
 
 		 917 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  20.77 
 
 		 569 aa  47.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0598  conjugal transfer ATPase TrbE  20.25 
 
 		 809 aa  47  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  22 
 
 		 810 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  23.98 
 
 		 954 aa  47  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  24.52 
 
 		 954 aa  46.6  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  22.14 
 
 		 610 aa  45.8  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0565  hypothetical protein  20.99 
 
 		 945 aa  45.8  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  21.17 
 
 		 955 aa  45.8  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.61 
 
 		 611 aa  45.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  29.2 
 
 		 696 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1119  Type IV secretory pathway, VirB4 component  29.37 
 
 		 651 aa  45.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0551888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  23.31 
 
 		 960 aa  44.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  22.49 
 
 		 941 aa  44.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  23.32 
 
 		 973 aa  44.3  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>