98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4176 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 104 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  48.96 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  61.25 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  46.24 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  42.22 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  43.02 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  41.11 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  40.66 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  39.36 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  40.28 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  42.86 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 256 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 300 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  40.98 
 
 		 359 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  34 
 
 		 312 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  35.38 
 
 		 342 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 210 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 198 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  32.86 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  30.21 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 244 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  32.81 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4971  helix-turn-helix domain protein  31.76 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 213 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  35.94 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0155  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  30.67 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 145 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  31.82 
 
 		 395 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 478 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  25.89 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  25.89 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.75 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 374 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  25.89 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 446 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2265  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  30.77 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  28.04 
 
 		 114 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 231 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 142 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>