40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6926 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  220  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  90 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  75.51 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  59.52 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 107 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  44.55 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  48.84 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  41.41 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  50.68 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  44.09 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  48.61 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  40.86 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  40.86 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  46.99 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  44.32 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  46.75 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  41.05 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  50 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  49.25 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  39.24 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  30.77 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  38.24 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>