49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6488 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 107 aa  213  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  60.44 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  54.95 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  49.47 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  49 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  44.94 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  44.94 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  48.24 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  45.98 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  45.35 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  39.36 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  41.98 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  38.89 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6290  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4834  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 		 347 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>