35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1512 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  96.1 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  88.46 
 
 		 104 aa  147  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  87.18 
 
 		 95 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  72 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  58.06 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  54.1 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  52.24 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  56.9 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 112 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  48.48 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  49.15 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  49.15 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  37.5 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>