42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2922 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  70.97 
 
 		 95 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  67.74 
 
 		 104 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  69.89 
 
 		 99 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  72 
 
 		 78 aa  117  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  50.59 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  59.21 
 
 		 93 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  55.84 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  53.25 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  53.25 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  52.5 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  45.05 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  49.41 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  51.28 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  50.67 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  45.88 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  50.72 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  45.12 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  43.33 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  34.25 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  34.18 
 
 		 395 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  38.1 
 
 		 347 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  40.3 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  38.57 
 
 		 227 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  37.68 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>