68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4406 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 108 aa  218  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  86.41 
 
 		 111 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  75.96 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  54.95 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  47 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  48.31 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  49.45 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  47.44 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  43.04 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  43.42 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  44.59 
 
 		 118 aa  66.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  39.51 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4834  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6290  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  37.14 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0155  helix-turn-helix domain-containing protein  29.2 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  36.76 
 
 		 347 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1041  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  36.62 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  36.25 
 
 		 355 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3522  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0971  transcriptional regulator, XRE family  29.36 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.508784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3762  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1168  transcriptional regulator, XRE family  29.36 
 
 		 142 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.092853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  32.88 
 
 		 131 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1563  transcriptional regulator, XRE family  27.43 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3775  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  40.3 
 
 		 264 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  40.3 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 		 352 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 174 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.99 
 
 		 111 aa  40  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.99 
 
 		 111 aa  40  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.99 
 
 		 111 aa  40  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>