46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1541 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  210  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  61.84 
 
 		 86 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 108 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  57.89 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  57.89 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  56.58 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  55 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  48.24 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  54.32 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  44.94 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  48.31 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  48.31 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  48.31 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  57.97 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  48.84 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  48.89 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  43.82 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  44.71 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  48.68 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  45.78 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  43.06 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  42.31 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  36.92 
 
 		 347 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 352 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  36.51 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 255 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.23 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  42.62 
 
 		 400 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 256 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  32.31 
 
 		 395 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  32.31 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 359 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>