46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1498 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 92 aa  194  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  56.18 
 
 		 93 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  62.03 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  61.54 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  53.93 
 
 		 86 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  55.7 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  44.3 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  48.08 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  38.71 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  37.97 
 
 		 355 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2219  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 244 aa  42.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 274 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  38.1 
 
 		 357 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  31.82 
 
 		 395 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>